我搭建的是JIRA6.1.5，使用的是JIRA免安装包，解压后经过以下三步可以成功运行。
　　一、配置JAVA环境变量
　　二、设置JIRA_HOME工作目录
　　三、解压JIRA下载包，然后./bin/start-jira.sh启动jira。
　　以上详细步骤在我的文章Linux 下安装、配置、汉化JIRA6.1.5中有详细的说明。
　　我用网上找的在/etc/init.d/rc.local文件中加./**/start-jira.sh服务进程是启动的了，但是无法正常
　　在启动过程中出现了错误，进入atlassian-jira6.1.5-standalone/bin目录，重新启动JIRA
　　#./start-jira.sh
　　JIRA服务器可以正常使用，但是还是没有完成开机自启动。
　　然后在网上找了别的方法，编写JIRA的启动脚本。
　　在/etc/init.d/目录中创建JIRA启动脚本
　　#cd /etc/ini.d/
　　#vim jira
　　以下是JIRA启动脚本的内容
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#!/bin/bash
#chkconfig: 2345 85 15
# description: jira
# processname: jira
# source function library
. /etc/init.d/functions
#把JAVA的环境变量配置也加进来
JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-amd64
CLASSPATH=.:$CLASSPATH:$JAVA_HOME/lib/dt.jar:$JAVA_HOME/lib/tools.jar:$JAVA_HOME/lib/mysql-connector-java-5.1.29-bin.jar:$JAVA_HOME/lib/classes12.jar
PATH=$PATH:$JAVA_HOME/bin:$JAVA_HOME/jre/bin
export JAVA_HOME  PATH  CLASSPATH
#设置JIRA的工作目录JIRA_HOME
JIRA_HOME=/home/jira_workhome/work_home
export JIRA_HOME
#这一行为JIRA的安装路径（主目录），我的是直接 在/home/jira_workhome里面解压的。
Jira=/home/jira_workhome/atlassian-jira-6.1.5-standalone
startup=$Jira/bin/startup.sh
shutdown=$Jira/bin/shutdown.sh
#export JAVA_HOME=/usr/lib/jvm/java-6-openjdk-amd64
#每次非正常关机后，启动的时候都需要将$Jira_Home中的.jira-home.lock文件删除，否则启动的时候会报错。
.jira-home.lock是一个锁文件，是为了保护jira安全的。
rm -rf /home/jira_workhome/work_home/.jira-home.lock
start() {
echo -n $"Starting jira services: "
$startup
RETVAL=$?
echo
}
stop() {
echo -n $"Shutting down jira services: "
$shutdown
RETVAL=$?
echo
}
case "$1" in
start)
start
;;
stop)
stop
;;
restart|reload)
stop
start
;;
status)
status jira
RETVAL=$?
;;
*)
echo $"Usage: $0 {start|stop|restart|status}"
exit 1
esac
exit $RETVAL
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